Der Masterstudiengang Medizinpädagogik im Department Pädagogik wird als Teilzeitstudiengang angeboten, in der Regel üben die Studierenden eine Tätigkeit in einem Gesundheitsberuf aus oder unterrichten bereits in den verschiedenen Bildungseinrichtungen des Gesundheitswesens. Hierdurch können die Studierenden die während der Lehr-Lernveranstaltungen gewonnenen Erkenntnisse nutzen, um den beruflichen Alltag theoriegeleitet zu analysieren und kritisch zu reflektieren.
Im Masterstudiengang Medizinpädagogik werden im Rahmen des Studienprogramms fachdidaktisch-orientierte Studien durchgeführt, die im Sinne des hochschuldidaktischen Ansatzes des Forschenden Lernens den Prozess eines praxisbezogenen Forschungsvorhabens umsetzen.